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Python 已經(jīng)成為世界上最流行的編程語(yǔ)言,尤其在深度學(xué)習(xí)、數(shù)據(jù)科學(xué)等領(lǐng)域占據(jù)主導(dǎo)地位。但是由于其解釋執(zhí)行的屬性,Python 較低的性能很影響它在計(jì)算密集(比如多重 for 循環(huán))的場(chǎng)景下發(fā)揮作用,實(shí)在讓人又愛又恨。如果你是一名經(jīng)常需要使用 Python 進(jìn)行密集計(jì)算的開發(fā)者,我相信你肯定會(huì)有下面的類似經(jīng)歷:

創(chuàng)新互聯(lián)主要企業(yè)基礎(chǔ)官網(wǎng)建設(shè),電商平臺(tái)建設(shè),移動(dòng)手機(jī)平臺(tái),成都小程序開發(fā)等一系列專為中小企業(yè)定制網(wǎng)站設(shè)計(jì)產(chǎn)品體系;應(yīng)對(duì)中小企業(yè)在互聯(lián)網(wǎng)運(yùn)營(yíng)的各種問題,為中小企業(yè)在互聯(lián)網(wǎng)的運(yùn)營(yíng)中保駕護(hù)航。
如果你有類似的煩惱,那真的值得了解一下 Taichi。我來(lái)簡(jiǎn)單介紹一下:Taichi 是一個(gè)嵌入在 Python 中的領(lǐng)域特定語(yǔ)言,其一大功能就是加速 Python。Taichi 通過自己的編譯器將被 @ti.kernel 修飾的函數(shù)編譯到各種硬件上,包括 CPU 和 GPU,然后高性能執(zhí)行。
(用戶不用關(guān)心的)Taichi 運(yùn)行原理:Python 代碼被 Taichi 編譯器編譯到高性能二進(jìn)制
由于 Taichi 開發(fā)者社區(qū)花了大量的精力優(yōu)化 Taichi 在 Python 中的使用體驗(yàn),所有的 Taichi 功能都可以在 import taichi as ti 以后使用,Taichi 本身也可以使用 pip 進(jìn)行安裝。當(dāng)然,Taichi 也可以與常用的 Python 包(numpy、matplotlib、PyTorch 等)進(jìn)行交互。
在這篇文章中,我們將通過三個(gè)計(jì)算例子來(lái)演示如何使用 Taichi 讓你的 Python 輕松加速 > 50 倍。這三個(gè)例子是:1. 計(jì)算質(zhì)數(shù)數(shù)目;2. 動(dòng)態(tài)規(guī)劃求解最長(zhǎng)公共子序列;3. 求解反應(yīng)-擴(kuò)散方程。
https://github.com/taichi-dev/faster-python-with-taichi
作為開胃小菜,我們先做一個(gè)小實(shí)驗(yàn):計(jì)算小于給定正整數(shù) 的素?cái)?shù)的個(gè)數(shù)。相信任何對(duì) Python 有基礎(chǔ)了解的人都不難寫出類似下面這樣的解法:
"""Count the number of primes in range [1, n].
"""
def is_prime(n: int):
result = True
for k in range(2, int(n ** 0.5) + 1):
if n % k == 0:
result = False
break
return result
def count_primes(n: int) -> int:
count = 0
for k in range(2, n):
if is_prime(k):
count += 1
return count
print(count_primes(1000000))
這個(gè)方法的思路簡(jiǎn)單且粗暴:我們用一個(gè)函數(shù) is_prime 來(lái)判斷某個(gè)正整數(shù) n 是不是素?cái)?shù),是素?cái)?shù)則返回 1,不是則返回 0。這只要遍歷檢查從 2 到√n 之間是否有整數(shù)能夠整除 n 即可。然后將小于N 的全部整數(shù)依次代入此函數(shù)并統(tǒng)計(jì)結(jié)果。將上面的代碼保存為 count_primes.py,在命令行運(yùn)行:
time python count_primes.py
在我的電腦上輸出的運(yùn)行結(jié)果是:
78498
real 0m2.235s
user 0m2.235s
sys 0m0.000s
耗時(shí) 2.235 秒。也許代碼中N 設(shè)置成一百萬(wàn)對(duì)你的電腦來(lái)說太輕松了,要不要把N 改成一千萬(wàn)試試?我打賭不管你的電腦多么高端,你起碼都要等個(gè)半分鐘才能看到結(jié)果。
好了下面是魔法時(shí)刻:我們不修改上面的函數(shù)體,只 import 一個(gè)“庫(kù)”,然后給兩個(gè)函數(shù)分別加一個(gè)裝飾器:
"""Count the number of primes below a given bound.
"""
import taichi as ti
ti.init()
@ti.func
def is_prime(n: int):
result = True
for k in range(2, int(n ** 0.5) + 1):
if n % k == 0:
result = False
break
return result
@ti.kernel
def count_primes(n: int) -> int:
count = 0
for k in range(2, n):
if is_prime(k):
count += 1
return count
print(count_primes(1000000))
仍然運(yùn)行 time python count_primes.py 命令,輸出的結(jié)果是:
78498
real 0m0.363s
user 0m0.546s
sys 0m0.179s
速度直接 x6! 而將改成一千萬(wàn)的話,Taichi 的耗時(shí)只會(huì)增加到 0.8s 左右,而 Python 則需要大約 55 秒,Taichi 直接加速了 70 倍!不僅如此,我們還可以在 ti.init 中加上 ti.init(arch=ti.gpu) 參數(shù),指定 Taichi 使用 GPU 來(lái)進(jìn)行計(jì)算。在 GPU 上同樣的計(jì)算 Taichi 只花了不到 0.45 秒,比 Python 足足快了 120 倍!你可以運(yùn)行這里的代碼親身體會(huì)一下。
上面這個(gè)計(jì)算素?cái)?shù)的例子使用的方法有點(diǎn)土,作為習(xí)題還可以,但在實(shí)際生產(chǎn)中就顯得不那么實(shí)用了。我們接下來(lái)看一個(gè)實(shí)際中普遍使用的算法。
動(dòng)態(tài)規(guī)劃(Dynamic Programming)是一類特別實(shí)用的算法,這類算法的哲學(xué)是以空間換時(shí)間,通過存儲(chǔ)中間計(jì)算結(jié)果來(lái)減少重復(fù)計(jì)算量。我們這里選擇一個(gè)求解最長(zhǎng)公共子序列(Longest common subsequence, LCS)的例子 (算法導(dǎo)論的讀者有木有)。
插播兩個(gè)來(lái)自淵鳴的《算法導(dǎo)論》小故事:
言歸正傳。所謂子序列,就是一個(gè)序列的子集,但是保持它們?cè)谠蛄兄械捻樞?。比如說 [1, 2, 1] 是 [1, 2, 3, 1] 的子序列,而 [3, 2] 則不是。我們這里考慮對(duì)兩條給定的序列,求出它們最長(zhǎng)公共子序列的長(zhǎng)度。最長(zhǎng)公共子序列就是兩個(gè)序列的所有公共子序列中最長(zhǎng)的一條 (這個(gè)最長(zhǎng)子序列未必唯一,但它的長(zhǎng)度是唯一確定的)。
舉個(gè)例子:
a = [0, 1, 0, 2, 4, 3, 1, 2, 1]
和
b = [4, 0, 1, 4, 5, 3, 1, 2]
的最長(zhǎng)公共子序列是
LCS(a, b) = [0, 1, 4, 3, 1, 2]
最長(zhǎng)公共子序列有很多應(yīng)用。比如大家日常使用的 Linux diff 命令和 git 工具(比較兩個(gè)文件之間的相似度),還有生物信息學(xué)中判斷兩段基因的相似度(把數(shù)字換成 ACGT 就行),其中的實(shí)現(xiàn)都用到了 LCS。
動(dòng)態(tài)規(guī)劃計(jì)算 LCS 的想法是我們依次求解序列 a 的前 i 個(gè)元素和序列 b 的前 j 個(gè)元素的最長(zhǎng)公共子序列的長(zhǎng)度,通過讓 i 和 j 逐漸增加我們就逐步得出了最終的結(jié)果。我們用 f[i, j] 表示 LCS((prefix(a, i), prefix(b, j),其中 prefix(a, i) 表示序列 a 的前 i 個(gè)元素,即 a[0], a[1], ..., a[i - 1]。這樣我們就得到遞推式:
f[i, j] = max(f[i - 1, j - 1] + (a[i - 1] == b[j - 1]),
max(f[i - 1, j], f[i, j - 1]))
于是,一個(gè) LCS 算法用 Python 可以很自然地書寫為:
for i in range(1, len_a + 1):
for j in range(1, len_b + 1):
f[i, j] = max(f[i - 1, j - 1] + (a[i - 1] == b[j - 1]),
max(f[i - 1, j], f[i, j - 1]))
這里我們給出一個(gè) Taichi 的加速實(shí)現(xiàn):
import taichi as ti
import numpy as np
ti.init(arch=ti.cpu)
benchmark = True
N = 15000
f = ti.field(dtype=ti.i32, shape=(N + 1, N + 1))
if benchmark:
a_numpy = np.random.randint(0, 100, N, dtype=np.int32)
b_numpy = np.random.randint(0, 100, N, dtype=np.int32)
else:
a_numpy = np.array([0, 1, 0, 2, 4, 3, 1, 2, 1], dtype=np.int32)
b_numpy = np.array([4, 0, 1, 4, 5, 3, 1, 2], dtype=np.int32)
@ti.kernel
def compute_lcs(a: ti.types.ndarray(), b: ti.types.ndarray()) -> ti.i32:
len_a, len_b = a.shape[0], b.shape[0]
ti.loop_config(serialize=True) # 避免 Taichi 自動(dòng)并行
for i in range(1, len_a + 1):
for j in range(1, len_b + 1):
f[i, j] = max(f[i - 1, j - 1] + (a[i - 1] == b[j - 1]),
max(f[i - 1, j], f[i, j - 1]))
return f[len_a, len_b]
print(compute_lcs(a_numpy, b_numpy))
將上面的代碼保存為 lcs.py,然后在終端運(yùn)行:
time python lcs.py
得到的結(jié)果為(具體結(jié)果每次未必一致):
2721
real 0m1.409s
user 0m1.112s
sys 0m0.549s
我們?cè)诖a中同時(shí)提供了分別使用 Taichi 和 Numpy 計(jì)算的版本,在我的電腦上對(duì)兩個(gè)長(zhǎng)度是 N=15000 的隨機(jī)序列進(jìn)行計(jì)算 Taichi 版本大約需要 0.9 秒,而 Python 則需要 476s,足足差了 500 多倍!大家可以運(yùn)行一下體會(huì) Taichi 相對(duì) Numpy 那種飛一樣的感覺。
當(dāng)然,Numpy 主要針對(duì)的場(chǎng)景是以數(shù)組為基本單位的運(yùn)算,遇到這種需要在數(shù)組內(nèi)更細(xì)粒度進(jìn)行計(jì)算的情況就比較無(wú)力了。而這正是 Taichi 能夠發(fā)揮作用的地方。
在大自然中我們常常會(huì)在動(dòng)植物的表面見到一些有趣的圖案,比如斑馬身上的條紋,獵豹身上的斑點(diǎn),河豚表面的花紋等等。
這些圖案看起來(lái)是不規(guī)則的,但是又有一定的規(guī)律,并不完全隨機(jī)。從進(jìn)化的觀點(diǎn),這些圖案是生物在長(zhǎng)期演進(jìn)和自然選擇中逐漸形成的,但到底是什么規(guī)則決定了它們的形狀一直是個(gè)有趣的問題。阿蘭 . 圖靈 (正是圖靈機(jī)的發(fā)明人) 是最早注意到這一現(xiàn)象并嘗試給出模型描述的人。他在論文 "The Chemical Basis of Morphogenesis" 中提出可以用兩種化學(xué)物質(zhì) U, V 之間的相互作用來(lái)模擬圖案的形成過程,其中物質(zhì) U 的角色類似被捕食者 (prey),物質(zhì) V 的角色類似捕食者 (predator)。它們之間的作用服從如下規(guī)則:
于是整個(gè)過程可以用下面的反應(yīng) - 擴(kuò)散方程描述:
這里關(guān)鍵的控制參數(shù)有四個(gè),分別是 Du, Dv , f,k,Du, Dv , 分別控制 U, V 的擴(kuò)散速度, f 代表 feed,控制 U 的添加量,而 k代表 kill,控制移走 V 的比例。
為了在 Taichi 中模擬這一過程,我們將空間劃分為網(wǎng)格,每個(gè)網(wǎng)格中 U, V 的濃度值用一個(gè) vec2 來(lái)表示。注意拉普拉斯算子Δ的數(shù)值計(jì)算是需要訪問當(dāng)前網(wǎng)格周圍的網(wǎng)格的,為了避免一邊修改一邊讀取這種操作的發(fā)生,我們需要開辟兩個(gè)形狀為W×H×2 的網(wǎng)格,每次用其中一個(gè)網(wǎng)格的值作為舊值,將更新后的濃度值寫入另一個(gè)網(wǎng)格中,然后交換兩個(gè)網(wǎng)格的角色。所以我們需要的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)應(yīng)該是:
W, H = 800, 600
uv = ti.Vector.field(2, float, shape=(2, W, H))
初始時(shí),我們假定網(wǎng)格中 U 的濃度處處是 1,然后隨機(jī)選擇 50 個(gè)點(diǎn)撒上 V:
import numpy as np
uv_grid = np.zeros((2, W, H, 2), dtype=np.float32)
uv_grid[0, :, :, 0] = 1.0
rand_rows = np.random.choice(range(W), 50)
rand_cols = np.random.choice(range(H), 50)
uv_grid[0, rand_rows, rand_cols, 1] = 1.0
uv.from_numpy(uv_grid)
實(shí)際的計(jì)算代碼非常之簡(jiǎn)短:
@ti.kernel
def compute(phase: int):
for i, j in ti.ndrange(W, H):
cen = uv[phase, i, j]
lapl = uv[phase, i + 1, j] + uv[phase, i, j + 1] + uv[phase, i - 1, j] + uv[phase, i, j - 1] - 4.0 * cen
du = Du * lapl[0] - cen[0] * cen[1] * cen[1] + feed * (1 - cen[0])
dv = Dv * lapl[1] + cen[0] * cen[1] * cen[1] - (feed + kill) * cen[1]
val = cen + 0.5 * tm.vec2(du, dv)
uv[1 - phase, i, j] = val
這里我們使用了取值為 0 或 1 的整數(shù) phase 來(lái)控制使用 uv 的哪一層來(lái)作為舊的網(wǎng)格,并將更新的值寫入 1-phase 對(duì)應(yīng)的層中。
非常有趣的是,雖然 V 的初始濃度是隨機(jī)設(shè)置的,但是最終得到的圖案卻具有相似性。
我們?cè)诖a中提供了基于 Taichi 和 Numba 的兩份不同的實(shí)現(xiàn),Taichi 的版本由于使用了 GPU 進(jìn)行計(jì)算,計(jì)算的部分可以輕松達(dá)到 300+ fps,而 Numba 的版本計(jì)算部分雖然也是編譯執(zhí)行的,但由于是在 CPU 上計(jì)算的,只有大約 30fps 左右。大家可以親自運(yùn)行代碼體會(huì)一下 Taichi 使用 GPU 加速的巨大優(yōu)勢(shì)。
在這三個(gè)例子上 Taichi 都讓程序有了大幅加速。主要的性能來(lái)自三點(diǎn):
當(dāng)然,加速 Python 還有很多其他工具,這里我們分析一下他們和 Taichi 的優(yōu)劣。
與 Numpy/JAX/PyTorch/TensorFlow 比較:這幾類工具都高度基于數(shù)組運(yùn)算。計(jì)算的最小單位是數(shù)組,在 Data Science、Deep Learning 等領(lǐng)域是有明顯的優(yōu)勢(shì)的。但是在科學(xué)計(jì)算領(lǐng)域,這樣做導(dǎo)致靈活性缺失:比如說前面那個(gè)計(jì)算質(zhì)數(shù)的程序,就比較難使用數(shù)組運(yùn)算表示出來(lái)。Taichi 的優(yōu)勢(shì)就在于其靈活性,能夠直接操縱循環(huán)的每一次迭代,以一種更細(xì)顆粒度進(jìn)行對(duì)于計(jì)算的描述,類似 C++ 和 CUDA。
與 Cython 比較:使用 Cython 編寫程序?qū)崿F(xiàn)加速也是一種常見的選擇。在 Numpy 和 Scipy 的官方代碼中有不少模塊都是使用 Cython 編寫然后編譯的。但按照 Cython 的要求書寫代碼會(huì)比較麻煩,會(huì)犧牲一些可讀性。Cython 支持一定程度的并行計(jì)算,但不支持直接調(diào)用 GPU 進(jìn)行計(jì)算。
與 Numba 比較:Numba 顧名思義,是非常適合針對(duì) Numpy 進(jìn)行加速的方案。當(dāng)你的函數(shù)是針對(duì) Numpy 的數(shù)組向量化的操作時(shí),使用 Numba 將其編譯以后執(zhí)行可以大大加速。Taichi 相比 Numba 的優(yōu)勢(shì)還有:1. Taichi 支持各種靈活的數(shù)據(jù)類型,比如 struct, dataclass, quant, sparse 等等,你可以任意指定它們的內(nèi)存排布,當(dāng)數(shù)據(jù)量龐大時(shí)這個(gè)優(yōu)勢(shì)會(huì)非常明顯。而 Numba 只有在針對(duì) Numpy 的稠密數(shù)組時(shí)效果最佳。2. Taichi 可以調(diào)用不同的 GPU 后端進(jìn)行計(jì)算,所以寫大規(guī)模并行程序(如粒子仿真、渲染器等)這種操作對(duì) Taichi 來(lái)說是小菜一碟。但你很難想象可以用 Numba 寫一個(gè)還過得去的 (哪怕離線) 渲染器。
與 Pypy 比較:Pypy 是一個(gè) Python 的 JIT 編譯器,這個(gè)工具 2007 年就有了,和 Taichi 的解決方案有些類似,都是通過編譯的方式加速 Python。Pypy 最大優(yōu)勢(shì)在于 Python 代碼完全不用改變,就能通過 Pypy 加速。但是這也是 Pypy 加速比率比 Taichi 低的原因:因?yàn)?Pypy 需要在編譯的同時(shí)保持 Python 所有的語(yǔ)言特性,所以能夠進(jìn)行的優(yōu)化比較有限。而 Taichi 有一套自己的語(yǔ)法,雖然和 Python 很像但是也有自己的一些假設(shè),這使得 Taichi 能夠?qū)崿F(xiàn)更大的加速。
與 ctypes 比較:ctypes 可以讓用戶在 Python 中調(diào)用 C 函數(shù)。C++、CUDA 編寫的程序也可以用過 C 接口暴露給 Python 使用。但是,ctypes 會(huì)讓工具鏈復(fù)雜化:為了寫一段比較快的程序,用戶需要同時(shí)掌握 C、Python、CMake、CUDA 等等語(yǔ)言,和本文描述的完全在 Python 中解決問題的方案比起來(lái)還是麻煩了一些。
總而言之,在科學(xué)計(jì)算任務(wù)上,Taichi 還是有自己獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)的,大家可以根據(jù)自己的需求選擇最合適的工具。如果你需要在 Python 中實(shí)現(xiàn)類似 C/C++ 語(yǔ)言的性能,Taichi 不失為一個(gè)理想的選擇!
最后,我們希望 Taichi 能夠?yàn)槟銕?lái)價(jià)值,也希望能夠聽到你對(duì) Taichi 的反饋,歡迎給我們提交 issues。如果想一鍵體驗(yàn) Taichi,只需要執(zhí)行
pip install -U taichi
并執(zhí)行
ti gallery
就可以體驗(yàn)各種基于 Taichi 的高性能可視化 Demos,期待與大家相遇!

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